Jean-Jacques Jauffret débute en tant qu'assistant réalisateur sur les films de René Féret, Jean-Claude Biette, Karim Dridi, Sylvie Durepère, Osawa, Jean-Jacques Kahn, Jean-Louis Skorecki. Puis il assiste Cyril Collard, depuis Taggers jusqu'à son dernier long-métrage, Les Nuits Fauves. Il devient producteur exécutif à partir de 1995, et travaille notamment sur Les Démons de Jésus de Bernie Bonvoisin, Sous les pieds des femmes de Rachida Krim, Déjà vu de François Vautier. En parallèle il réalise deux courts-métrages, Tout le monde est parfait et Je sais que c'était un Jeudi, et un documentaire Voyage d'Orient : le Bleu de Fez. Depuis 2003, il enseigne à l'ESRA (Ecole supérieure de réalisation audiovisuelle). Après le sud est son premier long-métrage.
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