Omar Zúñiga est né à Santiago au Chili. Cinéphile passionné, il est diplômé d’un Master de Beaux-Arts du Graduate Film Program à l’Université de New York, où il a fait ses études à l’aide de bourses telles que le Fullbright Program, le Ministère de l’Éducation du Chili, ou la Tisch School of the Arts. Vivant entre Santiago et Brooklyn, il a réalisé des courts-métrages qui ont été sélectionnés dans de nombreux festivals à travers le monde. En 2012 il réalise l’un des segments du film The Color Of Time dans lequel il dirige James Franco et Zach Braff, présenté au festival de Rome.
Son court-métrage San Cristóbal remporte le Teddy Award et le Prix du Meilleur court-métrage à la Berlinale de 2015. Il est le point de départ de ce qui deviendra son premier long-métrage Los Fuertes, soutenu par de nombreuses initiatives comme Ibermedia, Cine en Construcción au festival de San Sebastián, et lauréat du Grand Prix et du Prix du Public au festival Outfest de Los Angeles en 2020. En 2009, il co-fonde Cinestación, structure avec laquelle il produit ses projets mais aussi ceux d’autres réalisateurs chiliens prometteurs, comme Dominga Sotomayor qui reçoit le Léopard de la Meilleure réalisation à Locarno en 2019 avec Tarde Para Morir Joven, ou encore Meurs, Monstre, Meurs d’Alejandro Fadel sélectionné à Cannes en 2018 (Un Certain Regard).
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